全人类被神秘现象瞬间石化，漫长的数千年岁月悄然流逝——拥有超人般头脑的天才科学少年·石神千空苏醒了。在文明遭到毁灭的石之世界（STONE WORLD）里，千空决心运用科学的力量复原整个世界。与此同时，以拥有过人体力的儿时玩伴·大木大树为首的伙伴们也相继苏醒，他们从零开始创造文明——从石器时代到现代文明，绝对要跨越这科学史的200万年差距！然而，由“灵长类最强高中生”狮子王司统率的“武力帝国”始终阻挡在他们面前。以“净化人类”为目的的司，企图利用强大的武力阻止科学的发展。科学王国与武力帝国的对立一触即发，石之战争（STONE WARS）就此打响！千空一行人研发出电气、玻璃，甚至完成了情报战的最强武器——手机的研制，以此作为对抗司的筹码。科学 VS 武力，究竟鹿死谁手？前所未有的创世冒险谭，就此开幕！
