2012年2月，东京铁塔上空惊现一颗巨大的数码蛋。时间回溯至太一一行人告别数码世界之后，数码世界的大门并未就此向人类关闭，其内部的纷争也并未随和平的短暂降临而平息太久。为了维护数码世界与人类世界的双重安宁，新一代的“被选中的孩子”应运而生。此时，太一、阿和、素娜等初代主角已升入初中，因学业与成长的重担无暇再如昔日般与数码宝贝并肩作战，高石岳（阿武）与八神光（小光）便接过了引领新世代的重任。在本宫大辅、井之上京、火田伊织等新一代少年的集结下，他们携手亚古兽、加布兽等经典搭档，并迎来了全新的数码宝贝，在初代守护者的指引下，毅然开启了对抗邪恶势力的全新征程。 “这个世界充满了可能性。” 在眼前展现的这几个世界，时而让人感到希望，有时又令人觉得无情，但我们毫不犹豫地接受这些世界。因为那是通往新冒险之路的篇章，更是新的可能性的开始。 此时的本宫大辅（20岁）正与V仔兽一同修行拉面技艺。命运的齿轮再次转动，他遇到了一位随身携带着有裂纹的数码器、身边却没有搭档数码兽的神秘青年。这位迷之青年缓缓道出了一段震撼人心的隐秘过往—— “我没有数码兽。我的搭档数码兽被我杀了。我是世界上最初和数码兽建立搭档关系的人类。” 羁绊与宿命的交织，怀旧与新生的碰撞。昔日天使兽、甲龙兽、天鹰兽等经典数码宝贝相继亮相，帝王龙兽（龙模式）、妖精兽、噬光兽等也纷纷登场，而本作的核心主角——迷之青年小和田瑠衣亦首次现身。在这个充满未知与奇迹的世界里，新的数码宝贝与守护者们，即将谱写一场追溯数码世界起源的壮阔物语。