近未来世界，一种名为“HUGE”的神秘生命体凭空降临，将人类的命运推向了濒临灭绝的边缘。面对生死存亡的危机，世界各国携手合作，研发出能够与之抗衡的决战兵器——CHARM。而唯一能驾驭这些武器、守护人类希望的少女们，则被世人尊称为“莉莉”。 为了系统性地培养莉莉，世界各地建立起专门的训练学府“Garden”。每一所Garden都拥有独一无二的底蕴与传统，其中最为世人瞩目的名门，便是百合丘女学院。本作女主角一柳梨璃（赤尾光 配音）正是就读于此，她以某次事件为契机下定决心，凭借不懈的努力突破重围，作为替补合格入学。梨璃待人和善，拥有让人不知不觉便喜欢上她的天然魅力，虽然时常因为过度努力而冲过头，但始终抱有“不怕失败去挑战就能成功”的坚定信念。 在这所精英云集的学院中，梨璃结识了一群性格迥异却注定并肩作战的同伴：严于律己、因过往某段事件而封闭内心、待人冷淡却实力顶尖的白井梦结（夏吉优子 配音）；在入学考试中拔得头筹、出身名门望族且性格堂堂正正、厌恶卑劣手段的千金大小姐枫·J·努韦尔（井泽美香子 配音）；以及拥有超凡智力、以渊博的莉莉与战术知识为傲的资深“莉莉宅”二川二水（西本里美 配音）。 随着一柳队的正式结成，少女们踏上了前往东京执行任务的征途。以此事件为命运的齿轮，百合丘女学院、鲁德比克女学院、爱伦斯基女学园、神庭女子艺术高校、御台场女学校以及相模女子高等学馆的命运轨迹开始不可思议地交错。在这场残酷的生存之战中，莉莉们将用她们的勇气与羁绊，交织出属于未来的希望之花。