《隋唐英雄3》剧情紧接上部，讲述了玄武门之变后，李世民（郑国霖 饰）顺利登上皇位，开创贞观盛世的历史画卷。然而，隋朝的残余势力与十八反王留下的军队仍在北漠兴风作浪，危害百姓。已长大成才的罗通（张睿 饰）夺得帅位，率领唐军出征，在程铁牛（张卫健 饰）、秦怀玉（杨德民 饰）等一批小将的协助下，成功扫平了北漠。一波未平一波又起，渤辽国又兴兵攻唐，大唐将军程咬金（张卫健 饰）挂帅，在龙门县招兵。文武双全的薛仁贵（黄海冰 饰）泪别妻子柳金花（蔡静一 饰）投身军营，却在军中遭人冒功，屈居火头军。但他并未放弃，凭借一身盖世本领屡立战功，终得程咬金赏识，被举荐为先锋大将，最终率领唐军平定了渤辽国。柳金花在寒窑中苦等丈夫十年，薛仁贵功成之后不忘糟糠之妻，回到河东道绛州龙门县与妻儿团聚。同时，李世民在魏征（高森 饰）、长孙无忌（陈良平 饰）等贤臣的辅佐下，君臣同心，励精图治，共同开创了国泰民安的贞观盛世。