《十三格格新传》由真实历史改编而成。清朝末年，北洋水师兵败，惊惶失措的慈禧太后紧急召留洋归来的十三格格回宫辅佐政务。十三格格学以致用，凭借过人的智慧巧妙周旋于各种旧势力之间，虽几经风险，终得全身而退。北洋水师大败后，十三格格向慈禧献上铁路图，恭亲王奕欣举荐铁路专家张海生辅佐其修建样板铁路。修建过程中，玄亲王带头抗拆，李莲英的三弟亦带头私搭乱盖以骗取补偿款。十三格格亲临第一线，调查取证，指挥若定，终将众人制服。随后，慈禧的弟弟桂祥以给百姓钉门牌为由横征暴敛，引发百姓暴动，十三格格闻知此事毅然将其法办。在合作的过程中，十三格格与张海生逐渐产生了深厚的感情。然而，七贝勒因深爱十三格格以致因爱成狂，甚至贻误大事，被慈禧贬至东陵看守皇陵。后在十三的劝告下，慈禧决定与皇帝同祭东陵，以营造帝后和睦之象。不料李莲英的管家将消息出卖给匪徒，匪徒沿路狙击慈禧，幸得七贝勒飞身相救。最终匪徒被剿灭，七贝勒也壮烈牺牲。一年后，十三格格挽着张海生，在七贝勒的坟前默默祭拜。