在岭南的民间传说中，有一位家喻户晓的土郎中老吉。他虽出身贫寒，却聪明睿智、心地善良、刚直不阿且诙谐幽默。他不仅身怀绝技、医术高明，更常为百姓免费诊治，治愈了无数罕见的疑难杂症，深受广大群众爱戴，被当地百姓尊称为“药侠”。本剧正是在“老吉”传说的基础上，融入作者的深层思考，结合当代观众的审美趣味与价值取向，以电视连续剧的形式编纂而成。清朝光绪初年，岭南庆州一带瘟疫流行，一时间赤地千里、白日鬼唱，死者不计其数。朝廷赈灾银两一拨再拨，灾情却毫不见起色。两宫太后召集大臣商议对策，户部大臣、太医出身的吴一铭主动请缨，愿为钦差视察疫情、寻访良医、平瘟赈灾。然而，岭南知府孙子玉因有朝内神秘“主公”撑腰，勾结当地药霸贺天章贪污赈灾银两，大发国难财。孙知府不幸感染瘟疫，无奈请神医王老吉（谢钢 饰）救治。老吉开出“天价”，条件是知府必须免费供药救治百姓，孙知府为保性命，只好忍痛割肉。侠女赖红姑（杨丽菁 饰）为了让父亲十八年前蒙受的冤屈大白于天下，只身深入岭南。途中，她偶遇一伙蒙面杀手正与押镖人马厮杀，赖红姑拔刀相助，但为时已晚，镖首一字未吐便气绝身亡。赖红姑打开所押物品，赫然发现草药之下装的全是珍奇珠宝，且所有麻包上都写有一个醒目的“吉”字，她不由得疑窦顿生。在平定这场铺天盖地的特大瘟疫中，王老吉大显身手，并无意中揭开了一个贪赃枉法的黑洞，被朝廷封为“岭南药侠”。此后，他与奸商斗智打假，与神父斗法戒毒，与教主斗勇肃歼，件件义举在百姓中传为佳话。他应召入宫，在险象环生中凭借绝技躲过一次次杀身之祸；他爱慕美丽端庄、武艺高强的赖姑娘，却闹出了一系列令人捧腹的笑话。全剧通过民医王老吉的独特视角，生动展现了清末社会的人生百态。