《青天衙门Ⅱ》全剧由《将军之爱》、《望子成龙》、《审妻记》、《花轿奇谋》四个扣人心弦的单元故事组成。在一个旱雷闷响的漆黑夜晚，顺天府衙外传来阵阵凄厉的击鼓鸣冤声。一名泪水纵横、哭喊着冤屈的书童手持鼓棒，拼命敲鸣冤鼓。时任顺天府尹的谭振英闻讯，立刻率领衙役出门，连夜升堂审问事因。书童方庆被提到公堂之上，泣不成声地诉说起少爷方之栋与余清莲的悲惨遭遇。方之栋与余清莲本是一对青梅竹马的恋人，后因家境变故，清莲迫于无奈流落风尘，沦为暖香居的卖艺女子。为了给清莲赎身，方之栋日夜在街头卖字画攒钱。皇天不负有心人，之栋不仅将一支金钗赠予清莲作为定情信物，更将辛苦积攒下的五百两银子交至暖香居嬷嬷手中，终于为心上人赎得自由身。本以为有情人终成眷属，奈何天不遂人愿。就在之栋与清莲的新婚大喜之日，对清莲早已垂涎已久的富察家之后——富察家康，竟带领家丁恶仆强行闯入方家。他们不仅捣毁了喜堂，将上前理论的书童方庆打昏，更痛殴了上前阻拦斥责的方之栋，随后当众强行奸辱了余清莲，扬长而去。清莲身遭大辱，自感玷污了方家门风，在极度悲愤中含怨割腕自尽。之栋惊见清莲血流满地，悲痛至极，亦决意殉情，追随爱人而去。惨剧发生后，方家二老欲状告富察家康，但当地县令因惧怕得罪权倾朝野的九门提督，非但拒不受理此案，更屈打成招，严刑拷打方家二老。二老深感控诉无门，为防止顺天府尹与县令官官相护、包庇富察家康，两位悲愤交加的老人最终决意以死相谏，用生命来鸣诉这滔天冤情……