大明湖畔的夏雨荷离世后，女儿紫薇（林心如 饰）偕同丫环金锁（范冰冰 饰）带着乾隆（张铁林 饰）当年留给母亲的信物，千里迢迢从江南来到京城，一心期盼能与生父相认。然而，侯门深似海，平民女子根本无门进宫面圣。在走投无路之际，她们偶遇了行侠仗义的女飞贼小燕子，几经波折后结为挚友。不想因机缘巧合，本热心相助紫薇认父的小燕子，竟在狩猎场被箭射伤后，被乾隆错认为是自己流落民间的亲生女儿。为庆贺重获爱女，乾隆特意举行盛大的祭天酬神仪式。仪仗队伍行经市街时，混杂在人群中围观的紫薇与金锁赫然看到受封为“还珠格格”的小燕子。紫薇深受打击、情绪过激，当场昏倒在地，幸被大学士福伦之子福尔康（周杰 饰）所救。得知紫薇真实的皇家身世后，福家人将其妥善收留。其后，在福尔康的巧妙安排下，紫薇终得以与宫里的小燕子秘密见面。自此，众人开始为紫薇与乾隆的正式相认暗中筹谋、作种种安排。而在这一波三折的惊险过程中，紫薇与福尔康、小燕子与五阿哥永琪（苏有朋 饰）也各自开启了一段曲折动人的爱情之旅。